RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 MSRAQ9UJ68 235 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 USTQ9Y2C2 406 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 GBF1Q92538 1859 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 C2CD2LO14523 706 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRAP2O75791 330 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 GABBR2O75899 941 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 PROSCO94903 275 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRIK1P39086 918 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 SSR1P43307 286 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CACNA2D1P54289 1103 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADIGQ0VDE8 80 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAB30Q15771 203 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 TDHQ8IZJ6 230 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 EMC1Q8N766 993 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 C17orf80Q9BSJ5 609 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 L2HGDHQ9H9P8 463 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 LZTS1Q9Y250 596 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNK3O14649 394 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF185O15231 689 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D4O60343 1298 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAPN15O75808 1086 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 RB1P06400 928 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRLRP16471 622 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP2F1P24903 491 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC1A1P43005 524 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMARCB1Q12824 385 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 OLFML1Q6UWY5 402 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CPNE8Q86YQ8 564 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR65Q8IYL9 337 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBL4BQ8N7F7 174 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXO22Q8NEZ5 403 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLEC4CQ8WTT0 213 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCTD13Q8WZ19 329 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 HES6Q96HZ4 224 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM30AQ9NV96 361 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCMT1Q9UIC8 334 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTUS1Q9ULD2 1270 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 C5orf67F2Z3F1 127 aa18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSMA2P25787 234 aa18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPL34P49207 117 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 TKTL1P51854 596 aa18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CREMQ03060 361 aa18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 PBX4Q9BYU1 374 aa18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 NDUFV1P49821 464 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 OGDHQ02218 1023 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBE3AQ05086 875 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR17Q13304 367 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAF5Q15542 800 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC8B1Q6J4K2 584 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 COG1Q8WTW3 980 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CARD6Q9BX69 1037 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBXN6Q9BZV1 441 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBP1Q9H171 429 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 F8VP50 259 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGEF15O94989 841 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTSAP10619 480 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAJB2P25686 324 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CA8P35219 290 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 PBX2P40425 430 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC181Q5TID7 509 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMC7Q7Z402 723 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 MNS1Q8NEH6 495 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa18.08■□□□□ 0.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC66A2RUB6 948 aa18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDGFRAP16234 1089 aa18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPL17P18621 184 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPD1P21695 349 aa18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR1D2P34982 312 aa18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERVK-21P61565 698 aa18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFAP221Q4G0U5 840 aa18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms