RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 VPS45Q9NRW7 570 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 K7EQS6 105 aa8.68□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.68□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 CFAP45Q9UL16 551 aa8.68□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 UBE4BO95155 1302 aa8.68□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 A0A0A0MRY4 1105 aa8.67□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 TM4SF5O14894 197 aa8.67□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 ATP8B3O60423 1300 aa8.67□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 CAVIN2O95810 425 aa8.67□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.67□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 MED10Q9BTT4 135 aa8.67□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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COCH-211ENST00000557065 KAT7O95251 611 aa8.66□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 OLFM2O95897 454 aa8.66□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 OAS1P00973 400 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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