RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-208	ENST00000556007	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	TBX3	O15119	743 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	CCP110	O43303	1012 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	BCAR3	O75815	825 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	USP1	O94782	785 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	PDE8B	O95263	885 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	FGA	P02671	866 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	GK	P32189	559 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	PRKAG1	P54619	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	ETFDH	Q16134	617 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-208	ENST00000556007	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PMPCB	O75439	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	VNN1	O95497	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	FPR3	P25089	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC7A1	P30825	629 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	INSC	Q1MX18	579 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	USP19	O94966	1318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007		E5RJQ4	531 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	AP4M1	O00189	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PPEF2	O14830	753 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	KCNAB3	O43448	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	EXOC3	O60645	756 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	KLRC1	P26715	233 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	EPHA3	P29320	983 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PSG6	Q00889	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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