RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555677.5

IFT43-211, Transcript of intraflagellar transport 43, humanhuman

TSL 4

Gene IFT43, Length 487 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43-211ENST00000555677 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 FAM49BQ9NUQ9 324 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 CKMP06732 381 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 RPS9P46781 194 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 MRE11P49959 708 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 MAP3K7CLP57077 242 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 ZXDBP98169 803 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 WDR44Q5JSH3 913 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 FOXR2Q6PJQ5 311 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 SLITRK1Q96PX8 696 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 EBF3Q9H4W6 596 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 IL37Q9NZH6 218 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 MYO15AQ9UKN7 3530 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 CTNND2Q9UQB3 1225 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 BICDL2A1A5D9 508 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 ABL1P00519 1130 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 PFKLP17858 780 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 ADORA2BP29275 332 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 MAGEA9P43362 315 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 SLC5A3P53794 718 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 STX17P56962 302 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 RUNX3Q13761 415 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 ZNF77Q15935 545 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 ZNF394Q53GI3 561 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 MSANTD3Q96H12 275 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 ARID3AQ99856 593 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 LMAN1LQ9HAT1 526 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 HPS4Q9NQG7 708 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 KRT82Q9NSB4 513 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 CISHQ9NSE2 258 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 COMMD8Q9NX08 183 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 MYOFQ9NZM1 2061 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 CHRNB1P11230 501 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 TCF3P15923 654 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 CTHP32929 405 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 NBL1P41271 181 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 FMO5P49326 533 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 PDE6CP51160 858 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 PAK1Q13153 545 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 MTF1Q14872 753 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 CCDC40Q4G0X9 1142 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 C1orf228Q6PIY5 440 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 CLEC17AQ6ZS10 378 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 CLEC20AQ6ZU45 233 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 TTC16Q8NEE8 873 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 FBXO32Q969P5 355 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.96■□□□□ 0.15
IFT43-211ENST00000555677 F5P12259 2224 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 FAM92AA1XBS5 289 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 HHLA1C9JL84 531 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 PROB1E7EW31 1015 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 OLFM2O95897 454 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 OAS1P00973 400 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 FAM200BP0CF97 657 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 SP9P0CG40 484 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 ARSAP15289 507 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 RAD23BP54727 409 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 SLC7A9P82251 487 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 USP4Q13107 963 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 PON2Q15165 354 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 TTC39CQ8N584 583 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 PDZD8Q8NEN9 1154 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 LEFTY2O00292 366 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 PMM2O15305 246 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 LAMTOR5O43504 91 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 PGFP49763 221 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 LRMPQ12912 555 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 MTAPQ13126 283 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 CUL2Q13617 745 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT43-211ENST00000555677 PDGFRLQ15198 375 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms