RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP3CCP48454 512 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP27A1Q02318 531 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DMC1Q14565 340 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC6Q16204 474 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLK5Q496M5 336 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIGD1Q96MW7 591 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TM4SF5O14894 197 aa20.68■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM66O15016 1216 aa20.68■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TACC1O75410 805 aa20.68■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RHOBTB1O94844 696 aa20.68■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPYDQ12882 1025 aa20.68■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCED1BQ96HM7 432 aa20.68■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNX25Q9H3E2 840 aa20.68■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VPS45Q9NRW7 570 aa20.68■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.68■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR29P0C7W0 189 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNNI1P19237 187 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MPLP40238 635 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP46P62068 366 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE2HP62256 183 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ELF2Q15723 593 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STPG1Q5TH74 334 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RDH13Q8NBN7 331 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C8orf48Q96LL4 319 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FNBP1Q96RU3 617 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPAG17Q6Q759 2223 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LEFTY2O00292 366 aa20.66■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TGFB1I1O43294 461 aa20.66■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP2J2P51589 502 aa20.66■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC7A9P82251 487 aa20.66■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZXDBP98169 803 aa20.66■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSMD6Q15008 389 aa20.66■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.66■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RMND1Q9NWS8 449 aa20.66■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.66■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 F8VP50 259 aa20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OPRD1P41143 372 aa20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C11orf74Q86VG3 221 aa20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA20Q8TB22 786 aa20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP33Q8TEY7 942 aa20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CGRRF1Q99675 332 aa20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF38Q9H0F5 515 aa20.65■□□□□ 0.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 K7EQS6 105 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DCLK1O15075 740 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLIC2O15247 247 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EXOC3O60645 756 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMC2O95347 1197 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OLFM2O95897 454 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DGKEP52429 567 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNNC1P63316 161 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP24A1Q07973 514 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NME7Q9Y5B8 376 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RHOBTB3O94955 611 aa20.63■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABL1P00519 1130 aa20.63■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNA4P22459 653 aa20.63■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAF10Q12962 218 aa20.63■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STK4Q13043 487 aa20.63■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRPC3Q13507 836 aa20.63■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAB4Q2WGN9 574 aa20.63■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C2orf27AQ580R0 203 aa20.63■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.63■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.63■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.63■□□□□ 0.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms