RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552620.1

CHMP4A-210, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 2

Gene CHMP4A, Length 716 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-210ENST00000552620 JAK3P52333 1124 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 PSMC5P62195 406 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 CDR2Q01850 454 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 PTP4A2Q12974 167 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 CALCOCO2Q13137 446 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 XRCC4Q13426 336 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 SLC29A2Q14542 456 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 AOC3Q16853 763 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ZNF677Q86XU0 584 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 BBOF1Q8ND07 529 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ACER1Q8TDN7 264 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 CCT6BQ92526 530 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 KRT35Q92764 455 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 NT5C1BQ96P26 610 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 SERPINB12Q96P63 405 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 NUP85Q9BW27 656 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 KLC4Q9NSK0 619 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.36□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 MYH11P35749 1972 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 CFAP73A6NFT4 308 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 VGLL3A8MV65 326 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 C9IYK1 514 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 H0YCG3 227 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 CYP26A1O43174 497 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 PPIP5K2O43314 1243 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 RIPK2O43353 540 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 SPOPO43791 374 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 SHBGP04278 402 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 EPHX1P07099 455 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 NFICP08651 508 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 MMP10P09238 476 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 PYGMP11217 842 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 CYP11B1P15538 503 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 RXRBP28702 533 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 NOS3P29474 1203 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 PDE6CP51160 858 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 DLG4P78352 724 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 FMO1Q01740 532 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 GCNT1Q02742 428 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 DLGAP5Q15398 846 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 TKFCQ3LXA3 575 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM83AQ86UY5 434 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 PALB2Q86YC2 1186 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 ATL2Q8NHH9 583 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.35□□□□□ -1.39
CHMP4A-210ENST00000552620 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.35□□□□□ -1.39
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