RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
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CS-221ENST00000550734 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 EBF3Q9H4W6 596 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 KIF9Q9HAQ2 790 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 TDP1Q9NUW8 608 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 DSPP15924 2871 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 ABCA7Q8IZY2 2146 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 NOL4O94818 638 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 NR3C1P04150 777 aa12.29□□□□□ -0.44
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CS-221ENST00000550734 C1QTNF9P0C862 333 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 CYP2F1P24903 491 aa12.29□□□□□ -0.44
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CS-221ENST00000550734 NLRP12P59046 1061 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
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CS-221ENST00000550734 ELF2Q15723 593 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 WDR72Q3MJ13 1102 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 C4orf50Q6ZRC1 276 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 RIN3Q8TB24 985 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 GIPC2Q8TF65 315 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 CCDC34Q96HJ3 373 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 HHIPQ96QV1 700 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 SYT15Q9BQS2 421 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 PI4K2AQ9BTU6 479 aa12.29□□□□□ -0.44
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CS-221ENST00000550734 CRTAC1Q9NQ79 661 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 FASNP49327 2511 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 LNP1A1A4G5 178 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 C4orf47A7E2U8 309 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 APBB3O95704 486 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 CAVIN2O95810 425 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 ARSAP15289 507 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 GJA4P35212 333 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 MYL6P60660 151 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 TRPC3Q13507 836 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 TAF12Q16514 161 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 ZACNQ401N2 412 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 MON1AQ86VX9 555 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 MAB21L3Q8N8X9 362 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 ENGASEQ8NFI3 743 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 SPATA20Q8TB22 786 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 EXOC4Q96A65 974 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 SPATA17Q96L03 361 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 MMS19Q96T76 1030 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 P2RY13Q9BPV8 354 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 GDPD2Q9HCC8 539 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-221ENST00000550734 NBEAQ8NFP9 2946 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 GIPC1O14908 333 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 DCLK1O15075 740 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 HCRTO43612 131 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 CALUO43852 315 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 ATP2C2O75185 946 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 CEACAM1P13688 526 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 CASP4P49662 377 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 CREB5Q02930 508 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 NCOA4Q13772 614 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 DMC1Q14565 340 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 DDR2Q16832 855 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 CCDC142Q17RM4 750 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa12.27□□□□□ -0.45
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CS-221ENST00000550734 C1orf220Q5T0J3 134 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 TXNDC8Q6A555 127 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 C11orf74Q86VG3 221 aa12.27□□□□□ -0.45
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CS-221ENST00000550734 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa12.27□□□□□ -0.45
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CS-221ENST00000550734 TIGD1Q96MW7 591 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 GSDMAQ96QA5 445 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 SNX25Q9H3E2 840 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 ECT2Q9H8V3 914 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-221ENST00000550734 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa12.27□□□□□ -0.45
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