RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545303.5

TM7SF3-217, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 541 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-217ENST00000545303 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.57□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CPB2Q96IY4 423 aa6.57□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 KXD1Q9BQD3 176 aa6.57□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.57□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.57□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.57□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.57□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 PTGESO14684 152 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CCL16O15467 120 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 SLC37A4O43826 429 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 DNAJA2O60884 412 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ABLIM3O94929 683 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 THP07101 528 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 RHOP08100 348 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CHRNB1P11230 501 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 FCARP24071 287 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 PMLP29590 882 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 HOXA6P31267 233 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 OR1D2P34982 312 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ZNF165P49910 485 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CCR3P51677 355 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 LIMK1P53667 647 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 TFDP1Q14186 410 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 PPP2R5DQ14738 602 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 EMC2Q15006 297 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CDH24Q86UP0 819 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 RABGGTAQ92696 567 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 HAS1Q92839 578 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 BRF1Q92994 677 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 LXNQ9BS40 222 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 FZD8Q9H461 694 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 RGL1Q9NZL6 768 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 MTRRQ9UBK8 725 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 RAB23Q9ULC3 237 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 U3KQE9 123 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 TRIP11Q15643 1979 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ZZEF1O43149 2961 aa6.56□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CPA1P15085 419 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 PTPN2P17706 415 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 GLRA2P23416 452 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CXCL12P48061 93 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CAPSQ13938 189 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 XKR9Q5GH70 373 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CEP57Q86XR8 500 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 DYDC2Q96IM9 177 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 APOL6Q9BWW8 343 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 FRYQ5TBA9 3013 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.55□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.54□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 K7ESF4 209 aa6.54□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ARNTLO00327 626 aa6.54□□□□□ -1.36
TM7SF3-217ENST00000545303 ZNF197O14709 1029 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms