RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PCED1BQ96HM7 432 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM209Q96SK2 561 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TTLL2Q9BWV7 592 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 UBXN6Q9BZV1 441 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 LTB4R2Q9NPC1 389 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.467e-11■■■■■ 260.8
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CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA1468Q9P260 1216 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO4Q9UKT5 387 aa5.94□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF510Q9Y2H8 683 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PIAS3Q9Y6X2 628 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SCN1AP35498 2009 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 NCANO14594 1321 aa5.94□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 F5P12259 2224 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 KRBA1A5PL33 1030 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MED7O43513 233 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SOAT2O75908 522 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MBD3O95983 291 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ADH1CP00326 375 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 F11P03951 625 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TCF3P15923 654 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DRD1P21728 446 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 VIPR2P41587 438 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CCR2P41597 374 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CASP4P49662 377 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MFAP3P55082 362 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 COG7P83436 770 aa5.93□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZCWPW2Q504Y3 356 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SGO2Q562F6 1265 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TXNDC8Q6A555 127 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD40Q6AI12 368 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 VITQ6UXI7 678 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MAMSTRQ6ZN01 415 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF516Q92618 1163 aa5.93□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 NT5C1BQ96P26 610 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PKMYT1Q99640 499 aa5.93□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC46A2Q9BY10 475 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC3Q9BY71 257 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SMYD3Q9H7B4 428 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CRTAC1Q9NQ79 661 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 HEBP1Q9NRV9 189 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT82Q9NSB4 513 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TMLHEQ9NVH6 421 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 RWDD2AQ9UIY3 292 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MAN1B1Q9UKM7 699 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPRJQ12913 1337 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DOCK8Q8NF50 2099 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DENND4AQ7Z401 1863 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 E2F8A0AVK6 867 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF840PA6NDX5 716 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SART1O43290 800 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CILPO75339 1184 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 VNN1O95497 513 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 VNN2O95498 520 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 AFPP02771 609 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PAEPP09466 180 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM49P0CI25 452 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM49CP0CI26 452 aa5.92□□□□□ -1.46
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