RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MTSS1LQ765P7 747 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC105Q8IYK2 499 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SNX31Q8N9S9 440 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF527Q8NB42 609 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GALNT6Q8NCL4 622 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 OR4Q3Q8NH05 313 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 S100ZQ8WXG8 99 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 AP2M1Q96CW1 435 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CTRCQ99895 268 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 WWP1Q9H0M0 922 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 EPB41L4BQ9H329 900 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 AASSQ9UDR5 926 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 YEATS2Q9ULM3 1422 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MAFFQ9ULX9 164 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A1B0GVC2 190 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PLD2O14939 933 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZBTB5O15062 677 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CCNDBP1O95273 360 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NDUFA10O95299 355 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 STIP1P31948 543 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FNTAP49354 379 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ATP1A2P50993 1020 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NAGLUP54802 743 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ABATP80404 500 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PRKCZQ05513 592 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CNTN1Q12860 1018 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TAF13Q15543 124 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CERCAMQ5T4B2 595 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF425Q6IV72 752 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GAS2L3Q86XJ1 694 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 COG1Q8WTW3 980 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PIK3R3Q92569 461 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 KCNN1Q92952 543 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MS4A14Q96JA4 679 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CEP295NLQ96MC4 621 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF560Q96MR9 790 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 KLHL32Q96NJ5 620 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MKNK2Q9HBH9 465 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CKLFQ9UBR5 152 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 AMFRQ9UKV5 643 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CLCA2Q9UQC9 943 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 AIM2O14862 343 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ATP8B1O43520 1251 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 IDH1O75874 414 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CKBP12277 381 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MAKP20794 623 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ABL2P42684 1182 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RFX3P48380 749 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 VCPP55072 806 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MANFP55145 182 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 VSNL1P62760 191 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 P3H1Q32P28 736 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 DENND5AQ6IQ26 1287 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PRMT9Q6P2P2 845 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CATSPER4Q7RTX7 472 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RHOT1Q8IXI2 618 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ELMOD1Q8N336 334 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RDM1Q8NG50 284 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 OR5T2Q8NGG2 359 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 OR14K1Q8NGZ2 314 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SNAPC3Q92966 411 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ASIC4Q96FT7 647 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 BABAM1Q9NWV8 329 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 COMMD8Q9NX08 183 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TRPS1Q9UHF7 1281 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CDH9Q9ULB4 789 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PTPRCP08575 1304 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NUP155O75694 1391 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 A6NJR5 290 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 OPLAHO14841 1288 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GRAP2O75791 330 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms