RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	PSAP	P07602	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PCK1	P35558	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GPD2	P43304	727 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	HIF1A	Q16665	826 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CENPU	Q71F23	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ATG4C	Q96DT6	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FZD8	Q9H461	694 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897		A0A088AWK7	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NDC80	O14777	642 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PIAS1	O75925	651 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MARK3	P27448	753 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	VPS41	P49754	854 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MYL6	P60660	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KIF3C	O14782	793 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	AHCYL1	O43865	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CILP	O75339	1184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PSMG1	O95456	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KRT1	P04264	644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	AOC1	P19801	751 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	AMPD1	P23109	780 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ARL4C	P56559	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DBN1	Q16643	649 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	USP37	Q86T82	979 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SORT1	Q99523	831 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PLXNA3	P51805	1871 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GPR25	O00155	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KRT36	O76013	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SERPINB3	P29508	390 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RFC5	P40937	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	BACE1	P56817	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MTMR2	Q13614	643 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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