RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 EPS8L1Q8TE68 723 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 RIPOR3Q96MK2 946 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 CORO1BQ9BR76 489 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 TRIM5Q9C035 493 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 PIDD1Q9HB75 910 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 CAPN11Q9UMQ6 739 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM92AA1XBS5 289 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 LRRC53A6NM62 1247 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 ANXA13P27216 316 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 GPD2P43304 727 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 KCNQ1P51787 676 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 PLCB2Q00722 1185 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 BST2Q10589 180 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 GPIHBP1Q8IV16 184 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 NUP93Q8N1F7 819 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 ELMOD1Q8N336 334 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 WDTC1Q8N5D0 677 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 NECTIN4Q96NY8 510 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 AIPL1Q9NZN9 384 aa13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 CLUHO75153 1309 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 MED7O43513 233 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 F11P03951 625 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 PTMAP06454 111 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 SETSIPP0DME0 302 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 IL9P15248 144 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 CHRNB2P17787 502 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 PLA2G4AP47712 749 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 RPL34P49207 117 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC5A3P53794 718 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 RAB41Q5JT25 222 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 GAREM2Q75VX8 874 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 PIGZQ86VD9 579 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 LEMD2Q8NC56 503 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 SCAMP5Q8TAC9 235 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 OLIG1Q8TAK6 271 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 ITFG1Q8TB96 612 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 IQCDQ96DY2 449 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 TCEAL4Q96EI5 215 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 SYT11Q9BT88 431 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 COMMD8Q9NX08 183 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 HESX1Q9UBX0 185 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 CYTH4Q9UIA0 394 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 USP3Q9Y6I4 520 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 M0QYV0 167 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 TADA3O75528 432 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 BMP1P13497 986 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 PMF1Q6P1K2 205 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC20A1Q8WUM9 679 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 KCTD13Q8WZ19 329 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 LHX5Q9H2C1 402 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 ASAH2Q9NR71 780 aa13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 FERP16591 822 aa13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 FSHRP23945 695 aa13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 KIF11P52732 1056 aa13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM193AP78312 1265 aa13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 ZBED6P86452 979 aa13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 ARID5BQ14865 1188 aa13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 SHKBP1Q8TBC3 707 aa13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 ASB2Q96Q27 587 aa13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 MYH10P35580 1976 aa13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 MMEP08473 750 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 MYL4P12829 197 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 GJA1P17302 382 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 CASP14P31944 242 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 PRKCIP41743 596 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 FMO1Q01740 532 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 CDR2Q01850 454 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 AAK1Q2M2I8 961 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 CYP4A22Q5TCH4 519 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF677Q86XU0 584 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 STK32AQ8WU08 396 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 CPLX3Q8WVH0 158 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 OBSL1O75147 1896 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF197O14709 1029 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 CEBPBP17676 345 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 YWHAQP27348 245 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 GABRR2P28476 465 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 PGFP49763 221 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 PDE6CP51160 858 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 TAF10Q12962 218 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 SFMBT2Q5VUG0 894 aa13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4-208ENST00000533628 BHLHA9Q7RTU4 235 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms