RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 HHLA1C9JL84 531 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM200BP0CF97 657 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 LCP1P13796 627 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 PRLRP16471 622 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 TSPY1Q01534 308 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 RPS6KA1Q15418 735 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC39A12Q504Y0 691 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 OLFML1Q6UWY5 402 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 EMC1Q8N766 993 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 HSFY1Q96LI6 401 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 TTPALQ9BTX7 342 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 PROSCO94903 275 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGEF15O94989 841 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa23.1■■□□□ 1.29
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PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 GRAP2O75791 330 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP2F1P24903 491 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 MARCKSL1P49006 195 aa23.09■■□□□ 1.29
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PACSIN3-209ENST00000532457 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 KCTD13Q8WZ19 329 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 F8VP50 259 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
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PACSIN3-209ENST00000532457 SLC6A3Q01959 620 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 CREG2Q8IUH2 290 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.08■■□□□ 1.29
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PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF576Q9H609 170 aa23.08■■□□□ 1.29
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PACSIN3-209ENST00000532457 CHST7Q9NS84 486 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 EHD2Q9NZN4 543 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-209ENST00000532457 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.08■■□□□ 1.29
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PACSIN3-209ENST00000532457 VNN2O95498 520 aa23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 PEX5P50542 639 aa23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 ADCY1Q08828 1119 aa23.08■■□□□ 1.28
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PACSIN3-209ENST00000532457 CARD6Q9BX69 1037 aa23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 TCF4P15884 667 aa23.07■■□□□ 1.28
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PACSIN3-209ENST00000532457 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.07■■□□□ 1.28
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PACSIN3-209ENST00000532457 OR6C75A6NL08 312 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNK3O14649 394 aa23.06■■□□□ 1.28
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PACSIN3-209ENST00000532457 ARPP19P56211 112 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC8A3P57103 927 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 TAS2R40P59535 323 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 UBE3AQ05086 875 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 USP41Q3LFD5 358 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 RAB41Q5JT25 222 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF280DQ6N043 979 aa23.06■■□□□ 1.28
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PACSIN3-209ENST00000532457 ATAD1Q8NBU5 361 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 PGLYRP2Q96PD5 576 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 CERS4Q9HA82 394 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 TRANK1O15050 2925 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 H3BNC9 293 aa23.05■■□□□ 1.28
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PACSIN3-209ENST00000532457 TUBB2AQ13885 445 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 RAB6CQ53S08 254 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 GPR153Q6NV75 609 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 TTC9BQ8N6N2 239 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 RAB6CQ9H0N0 254 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 LZTS1Q9Y250 596 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 USTQ9Y2C2 406 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-209ENST00000532457 SPOPO43791 374 aa23.05■■□□□ 1.28
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