RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525127.1

BRMS1-204, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 750 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-204ENST00000525127 MDH1BQ5I0G3 518 aa15.62■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.62■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 TANGO2Q6ICL3 276 aa15.62■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 SMARCD2Q92925 531 aa15.62■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 E2F7Q96AV8 911 aa15.62■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 PCED1BQ96HM7 432 aa15.62■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ASB16Q96NS5 453 aa15.62■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 PHOX2BQ99453 314 aa15.62■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa15.62■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.097e-6■■□□□ 12.1
BRMS1-204ENST00000525127 KANSL1LA0AUZ9 987 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 KRT5P13647 590 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 CCR2P41597 374 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF75DP51815 510 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 BPIFB4P59827 614 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 PLCB2Q00722 1185 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ANGPT1Q15389 498 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 STILQ15468 1287 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 MEA1Q16626 185 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 MGAT5BQ3V5L5 792 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF394Q53GI3 561 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 FAM78AQ5JUQ0 283 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 VSTM1Q6UX27 236 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 FUKQ8N0W3 1084 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 PJA1Q8NG27 643 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 BAP1Q92560 729 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 DNASE1L2Q92874 299 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 PSMG2Q969U7 264 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 MYLPFQ96A32 169 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 CEP295NLQ96MC4 621 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 SPAG5Q96R06 1193 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 BRD9Q9H8M2 597 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 NLRC4Q9NPP4 1024 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 CAPN11Q9UMQ6 739 aa15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 NCAM2O15394 837 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 DCNP07585 359 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 PSMC3P17980 439 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 CLCN1P35523 988 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 SOX5P35711 763 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 STAT1P42224 750 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ORC1Q13415 861 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 TEAD2Q15562 447 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 SGO2Q562F6 1265 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 PAQR9Q6ZVX9 377 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 C12orf29Q8N999 325 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 SHKBP1Q8TBC3 707 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 IRF7Q92985 503 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 CYFIP2Q96F07 1278 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 GCNAQ96QF7 691 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 NELL2Q99435 816 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 CRISPLD1Q9H336 500 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 TRPV4Q9HBA0 871 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ATP8B3O60423 1300 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 A0A1W2PRU2 124 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 PROB1E7EW31 1015 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 O00370 1275 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 CYP26A1O43174 497 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 GFRA3O60609 400 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 GJA1P17302 382 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 CDC25BP30305 580 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 NBL1P41271 181 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 MAGEA9P43362 315 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ZBED6P86452 979 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 PTK2Q05397 1052 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ARID5BQ14865 1188 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 CNGA2Q16280 664 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 CCDC142Q17RM4 750 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 LCLAT1Q6UWP7 414 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 YAF2Q8IY57 180 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 SMARCD1Q96GM5 515 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 LPIN3Q9BQK8 851 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 FOXQ1Q9C009 403 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ATXN3LQ9H3M9 355 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 AIPL1Q9NZN9 384 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 NOTCH4Q99466 2003 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-204ENST00000525127 FAM170BA6NMN3 283 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-204ENST00000525127 MAN2B1O00754 1011 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms