RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFS2O75306 463 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TSPY3P0CV98 308 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TSPY8P0CW00 308 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PF4V1P10720 104 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 LPOP22079 712 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CST5P28325 142 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SHMT1P34896 483 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 BCAR1P56945 870 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 ADRM1Q16186 407 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 WDR78Q5VTH9 848 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.87□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 PPM1NQ8N819 430 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TTC8Q8TAM2 541 aa4.87□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 TRIB2Q92519 343 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SLF1Q9BQI6 1058 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PAGR1Q9BTK6 254 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 NAPBQ9H115 298 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJC18Q9H819 358 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 HELLSQ9NRZ9 838 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CTNNA3Q9UI47 895 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 FAM184BQ9ULE4 1060 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 FRMPD3Q5JV73 1810 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ELP1O95163 1332 aa4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PARP14Q460N5 1801 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0G2JNJ9 132 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PR48 441 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 H0YGN5 161 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 VWA5AO00534 786 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MBD4O95243 580 aa4.86□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 CYBAP13498 195 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MX1P20591 662 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CYP2B6P20813 491 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ADORA2AP29274 412 aa4.86□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 PURAQ00577 322 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 SEPT2Q15019 361 aa4.86□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZSN1 163 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 IQCA1Q86XH1 822 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 AUTS2Q8WXX7 1259 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 EXTL1Q92935 676 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 RAX2Q96IS3 184 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 PRO3102Q9H379 93 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 Q9UFV3 132 aa4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.86□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 C2orf78A6NCI8 922 aa4.85□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 CR2P20023 1033 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 RFC2P35250 354 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SLC1A4P43007 532 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PLCD1P51178 756 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ADAM8P78325 824 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PTH1RQ03431 593 aa4.85□□□□□ -1.63
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