RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF570Q96NI8 536 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MED10Q9BTT4 135 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DPPA5A6NC42 116 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SOCS7O14512 581 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MGEA5O60502 916 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ATP6V1G2O95670 118 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MCF2P10911 925 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RGS2P41220 211 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CPT1AP50416 773 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 KRT81Q14533 505 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CCL14Q16627 93 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RFX6Q8HWS3 928 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ABHD8Q96I13 439 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PMM2O15305 246 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SUPT3HO75486 399 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PROSCO94903 275 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PGK1P00558 417 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PIGRP01833 764 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RARAP10276 462 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 XRCC4Q13426 336 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ITGA7Q13683 1181 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TAPT1Q6NXT6 567 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SLFN11Q7Z7L1 901 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HACE1Q8IYU2 909 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 FZD8Q9H461 694 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 FAM187AA6NFU0 413 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 F8VP50 259 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TJP3O95049 919 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CYP1A2P05177 515 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 NDST1P52848 882 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MTM1Q13496 603 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RIPK1Q13546 671 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MFSD10Q14728 455 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TTC39CQ8N584 583 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ARL8AQ96BM9 186 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 FGD4Q96M96 766 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ASB7Q9H672 318 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TIMM22Q9Y584 194 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 GRIN2DO15399 1336 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CES2O00748 559 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PRPSAP2O60256 369 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HUS1O60921 280 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RECQL4O94761 1208 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HOXC6P09630 235 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PDGFRAP16234 1089 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PDCLQ13371 301 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MAMLD1Q13495 774 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 VMP1Q96GC9 406 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC77Q9BR77 488 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PIDD1Q9HB75 910 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms