RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 THEM5Q8N1Q8 247 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 C12orf29Q8N999 325 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 UBA3Q8TBC4 463 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 ALG3Q92685 438 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 BTBD6Q96KE9 485 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 SUSD3Q96L08 255 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 MCEEQ96PE7 176 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 CPXM1Q96SM3 734 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 CNPY3Q9BT09 278 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 ST7Q9NRC1 585 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM51Q9NW97 253 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.9□□□□□ -1.14
SEC31A-241ENST00000515749 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 PHF2O75151 1096 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 B3GAT3O94766 335 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 FBXO21O94952 628 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 TJP3O95049 919 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 POMCP01189 267 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 PYGMP11217 842 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 BMP1P13497 986 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 NPR3P17342 541 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 GPD1P21695 349 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 PSMA2P25787 234 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 LMO2P25791 158 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 FNTAP49354 379 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 DRG2P55039 364 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 SH3BP2P78314 561 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 PDE4CQ08493 712 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 DSC1Q08554 894 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 ORC1Q13415 861 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 CUL1Q13616 776 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 MTFR1Q15390 333 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 PTPRNQ16849 979 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 BOLA3Q53S33 107 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 C2CD6Q53TS8 623 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 WSCD1Q658N2 575 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 PMF1Q6P1K2 205 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 TTC30AQ86WT1 665 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 VSIG1Q86XK7 387 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 ABI1Q8IZP0 508 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 RNF169Q8NCN4 708 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 KRT35Q92764 455 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 ARMC5Q96C12 935 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 PNKPQ96T60 521 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 TBCBQ99426 244 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 KRT12Q99456 494 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 RAB17Q9H0T7 212 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 GDF3Q9NR23 364 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 NME7Q9Y5B8 376 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7.89□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 PTPRDP23468 1912 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 TSC2P49815 1807 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 C2CD4BA6NLJ0 364 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 E5RJQ4 531 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 F8VP50 259 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 SYN3O14994 580 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 NBNO60934 754 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 EFCAB14O75071 495 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 ALDH2P05091 517 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 FAM200BP0CF97 657 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 PDGFRAP16234 1089 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 PTPN9P43378 593 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 VSNL1P62760 191 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 TSPY1Q01534 308 aa7.88□□□□□ -1.15
SEC31A-241ENST00000515749 LMNB2Q03252 620 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms