RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504849.5

RFC1-208, Transcript of replication factor C subunit 1, human

TSL 3

Gene RFC1, Length 873 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFC1-208	ENST00000504849	HK3	P52790	923 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	DSC2	Q02487	901 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	GPS2	Q13227	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ADRM1	Q16186	407 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ITSN1	Q15811	1721 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TECPR2	O15040	1411 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	SBNO1	A3KN83	1393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	FLT4	P35916	1363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849		A0A1W2PPL8	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849		H0Y858	1186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849		H3BQV1	296 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	MYO1F	O00160	1098 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	SYT5	O00445	386 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	CD4	P01730	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	HOXB7	P09629	217 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	MCAM	P43121	646 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	RAC3	P60763	192 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	CDK17	Q00537	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	MGAT2	Q10469	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TUSC3	Q13454	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	CNGA2	Q16280	664 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	FOXB1	Q99853	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	GREM2	Q9H772	168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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