RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CES2	O00748	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	DSCR3	O14972	297 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	PMPCB	O75439	489 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	TH	P07101	528 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CYP2C9	P11712	490 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CCKAR	P32238	428 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	PLCD1	P51178	756 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	RAB1A	P62820	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	LMAN2	Q12907	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	FGL2	Q14314	439 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	MYO1C	O00159	1063 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	BTN3A1	O00481	513 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	GCAT	O75600	419 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	MT-CO3	P00414	261 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	PF4V1	P10720	104 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	GK	P32189	559 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	WNT3	P56703	355 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	GHRHR	Q02643	423 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	MYMK	A6NI61	221 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	AP1G1	O43747	822 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	ABLIM3	O94929	683 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	KIT	P10721	976 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	DIO1	P49895	249 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	PRKAG1	P54619	331 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	MLC1	Q15049	377 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	SPRY2	O43597	315 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	IGSF3	O75054	1194 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	UBXN7	O94888	489 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	ALPL	P05186	524 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	HTR1B	P28222	390 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	MAML1	Q92585	1016 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.5	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.49	□□□□□ -1.69
USP34-222	ENST00000498268	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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