RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ECM1	Q16610	540 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GIPC2	Q8TF65	315 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB34	Q9BZG1	259 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511		E9PMD0	336 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	JAK2	O60674	1132 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	LARGE1	O95461	756 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CLTA	P09496	248 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TYMP	P19971	482 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	LRPAP1	P30533	357 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO43	Q4G163	708 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC38	Q5R3I4	469 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT79	Q5XKE5	535 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF3C6	Q969F1	213 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	LNP1	A1A4G5	178 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ABLIM1	O14639	778 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	RARA	P10276	462 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CEACAM1	P13688	526 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ARSA	P15289	507 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP3A5	P20815	502 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	GALK1	P51570	392 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	GUCY2F	P51841	1108 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	DMC1	Q14565	340 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PDGFRL	Q15198	375 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT13	Q7L8C5	426 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf74	Q86VG3	221 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL23	Q86XA0	190 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SENP8	Q96LD8	212 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC32A1	Q9H598	525 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	LIG4	P49917	911 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	MCL1	Q07820	350 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	KYAT1	Q16773	422 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ME3	Q16798	604 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ZPBP2	Q6X784	338 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	DAW1	Q8N136	415 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB124	Q8NES8	71 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CD101	Q93033	1021 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf76	Q96K31	380 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TDP1	Q9NUW8	608 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	IGF2R	P11717	2491 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC26	A0AVF1	554 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54

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