RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496015.5

ABCD4-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,248 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-217ENST00000496015 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ECT2Q9H8V3 914 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 STX10O60499 249 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 AKAP3O75969 853 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SMC2O95347 1197 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 NFATC1O95644 943 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 HLA-DRAP01903 254 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TDGF1P13385 188 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 DRD1P21728 446 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CNR2P34972 360 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GAS6Q14393 721 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 FBXO43Q4G163 708 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 Q6ZS52 159 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ACOT1Q86TX2 421 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 FAM35AQ86V20 835 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 COMMD8Q9NX08 183 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CETN3O15182 167 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 AP1G2O75843 785 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GTF2H1P32780 548 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GJA4P35212 333 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GCLMP48507 274 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 NDST1P52848 882 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CACNA2D1P54289 1103 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SLC7A9P82251 487 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 EML3Q32P44 896 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 LONP2Q86WA8 852 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 RIN3Q8TB24 985 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 FBXO32Q969P5 355 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GSDMAQ96QA5 445 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 KCNK16Q96T55 309 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TSG101Q99816 390 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SDCBP2Q9H190 292 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 KRT82Q9NSB4 513 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 LEFTY2O00292 366 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TRIM49P0CI25 452 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TRIM49CP0CI26 452 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 HOXA6P31267 233 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ASPAP45381 313 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ID4P47928 161 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GALK1P51570 392 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 PNOCQ13519 176 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 WDR44Q5JSH3 913 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 HECTD3Q5T447 861 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 FUKQ8N0W3 1084 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 NACA2Q9H009 215 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CPQQ9Y646 472 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.46□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 K7ESF4 209 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 OLFM2O95897 454 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 FAM200BP0CF97 657 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 FNTBP49356 437 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 TUBP50607 506 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 SLC5A3P53794 718 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 PPP3CAQ08209 521 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 KRT39Q6A163 491 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 DCLK2Q8N568 766 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 TTC39CQ8N584 583 aa14.45□□□□□ -0.1
ABCD4-217ENST00000496015 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms