RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495113.5

TMBIM1-223, Transcript of transmembrane BAX inhibitor motif containing 1, human

TSL 2

Gene TMBIM1, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMBIM1-223	ENST00000495113	PDGFRA	P16234	1089 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCL23	P55773	120 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	IKBKE	Q14164	716 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	LRRC43	Q8N309	656 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	EMC1	Q8N766	993 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	PRELID2	Q8N945	189 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	SCLY	Q96I15	445 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	TBCB	Q99426	244 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	RAB17	Q9H0T7	212 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	LRRC19	Q9H756	370 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113		I3L4J1	428 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	TADA2A	O75478	443 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	DAB1	O75553	588 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	GABBR2	O75899	941 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	TJP3	O95049	919 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	OAZ2	O95190	189 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	ALDH2	P05091	517 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	LCP1	P13796	627 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	GBP1	P32455	592 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	CYP2C18	P33260	490 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	FLT3	P36888	993 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	CUL1	Q13616	776 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	RAB41	Q5JT25	222 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	AADACL2	Q6P093	401 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	VSIG1	Q86XK7	387 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	HASPIN	Q8TF76	798 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	TEKT4	Q8WW24	435 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLCO2A1	Q92959	643 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	USP18	Q9UMW8	372 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	12.73	□□□□□ -0.37	5e-7	■■■■■ 82
TMBIM1-223	ENST00000495113	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	OR6C75	A6NL08	312 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZNF487	B1APH4	448 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	PIK3R2	O00459	728 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	CLDN5	O00501	218 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	NRP1	O14786	923 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	KIAA0355	O15063	1070 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	PRPSAP2	O60256	369 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	B4GALT3	O60512	393 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	ITGB1	P05556	798 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	RARA	P10276	462 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	RALA	P11233	206 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	MIP	P30301	263 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	GJC1	P36383	396 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	EPHB4	P54760	987 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	MAP3K7CL	P57077	242 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	DR1	Q01658	176 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	ADCY1	Q08828	1119 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	ADIG	Q0VDE8	80 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	NNT	Q13423	1086 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	TAZ	Q16635	292 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	TCTN1	Q2MV58	587 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCDC14	Q49A88	953 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	BOLA3	Q53S33	107 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TMBIM1-223	ENST00000495113	EMB	Q6PCB8	327 aa		12.73	□□□□□ -0.37

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