RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 DPP3Q9NY33 737 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TCHHQ07283 1943 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 FAM149AA5PLN7 773 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF217O75362 1048 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ADH1CP00326 375 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ADH5P11766 374 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 MAOBP27338 520 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ITPKBP27987 946 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 WASP42768 502 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 CAMK2BQ13554 666 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 IL21RQ9HBE5 538 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 COL12A1Q99715 3063 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 H0YCG3 227 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 NDUFS2O75306 463 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 DKK1O94907 266 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 HOXB2P14652 356 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 NDUFV2P19404 249 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 ACOT2P49753 483 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 SV2CQ496J9 727 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 KRT79Q5XKE5 535 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 PKMYT1Q99640 499 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 ACBD6Q9BR61 282 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 RNF38Q9H0F5 515 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 PRORYQ9H606 182 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 C2CD2Q9Y426 696 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 CPQQ9Y646 472 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 A0A1W2PQF6 199 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 J3QKU1 62 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 PIGRP01833 764 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 PFKLP17858 780 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 TRAPPC10P48553 1259 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 NCKAP1LP55160 1127 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 SLC7A9P82251 487 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 MIB1Q86YT6 1006 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 NAT16Q8N8M0 369 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 FOXJ1Q92949 421 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 KIF2CQ99661 725 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 CDC6Q99741 560 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 RAB34Q9BZG1 259 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 ASB7Q9H672 318 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 GAREM1Q9H706 876 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 CD93Q9NPY3 652 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 HCN2Q9UL51 889 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 L1RE1Q9UN81 338 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 CILPO75339 1184 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 NTSR1P30989 418 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 USP46P62068 366 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF560Q96MR9 790 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-222ENST00000491867 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms