RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491658.1

TFRC-215, Transcript of transferrin receptor, human

TSL 5

Gene TFRC, Length 396 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFRC-215	ENST00000491658	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658		H7C4K7	107 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	PRKCB	P05771	671 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	E2F1	Q01094	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	NPY5R	Q15761	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	PRR25	Q96S07	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	RASAL1	O95294	804 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	ACVR2A	P27037	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
TFRC-215	ENST00000491658	TISP43	B9A030	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	AP4M1	O00189	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	RAB27B	O00194	218 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	RGS10	O43665	173 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	PIAS2	O75928	621 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	PDE8B	O95263	885 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	LATS1	O95835	1130 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	EPHA3	P29320	983 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	UQCRC1	P31930	480 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	GK	P32189	559 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	CPT1A	P50416	773 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658		F8W8V4	182 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658		H7C1Q1	480 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658		M0R3H8	397 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	PSMD9	O00233	223 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	PMPCB	O75439	489 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	FPR3	P25089	353 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	ITGA8	P53708	1063 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	TIRAP	P58753	221 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	GRM1	Q13255	1194 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	DDB2	Q92466	427 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	PHKB	Q93100	1093 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TFRC-215	ENST00000491658	SNX22	Q96L94	193 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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