RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 DEFB124Q8NES8 71 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 MDGA1Q8NFP4 955 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC26Q8TAB7 109 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 SAAL1Q96ER3 474 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 NFATC1O95644 943 aa12.56□□□□□ -0.4
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RABGEF1-207ENST00000484547 GAB4Q2WGN9 574 aa12.56□□□□□ -0.4
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RABGEF1-207ENST00000484547 GOLGA8JA6NMD2 632 aa12.55□□□□□ -0.4
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RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 ALLCQ8N6M5 410 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 TOP6BLQ8N6T0 577 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRC52Q8N7C0 313 aa12.55□□□□□ -0.4
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RABGEF1-207ENST00000484547 HVCN1Q96D96 273 aa12.55□□□□□ -0.4
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RABGEF1-207ENST00000484547 CFAP45Q9UL16 551 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 KNL1Q8NG31 2342 aa12.54□□□□□ -0.4
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RABGEF1-207ENST00000484547 C4orf50Q6ZRC1 276 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 LPCAT2Q7L5N7 544 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEFF1Q8IYR6 380 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 FRMD1Q8N878 549 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 OLIG1Q8TAK6 271 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 MYLPFQ96A32 169 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-207ENST00000484547 ACCSQ96QU6 501 aa12.54□□□□□ -0.4
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