RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	PLA2G4A	P47712	749 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PPP3CC	P48454	512 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	KLK7	P49862	253 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	KIF11	P52732	1056 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SLC8A3	P57103	927 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TPM4	P67936	248 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	UBXN1	Q04323	297 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TAF10	Q12962	218 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	RAB41	Q5JT25	222 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PARM1	Q6UWI2	310 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	MON1A	Q86VX9	555 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SMARCD2	Q92925	531 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	FBXO32	Q969P5	355 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	VCAN	P13611	3396 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887		F8VZ95	297 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887		M0QYV0	167 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TULP2	O00295	520 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	OLFM2	O95897	454 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CALCA	P01258	141 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PFKL	P17858	780 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	GNA15	P30679	374 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PDE4C	Q08493	712 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TDG	Q13569	410 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TXNDC8	Q6A555	127 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PIGZ	Q86VD9	579 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	E2F7	Q96AV8	911 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	KXD1	Q9BQD3	176 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	STK33	Q9BYT3	514 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ACP6	Q9NPH0	428 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	OBP2A	Q9NY56	170 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SCML2	Q9UQR0	700 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887		A0A1W2PQC6	194 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	C2orf78	A6NCI8	922 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CYP26A1	O43174	497 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TEX33	O43247	280 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	THAP12	O43422	761 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	MED7	O43513	233 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PRAMEF12	O95522	483 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ALAD	P13716	330 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CLCN1	P35523	988 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	USP8	P40818	1118 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TUB	P50607	506 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	JAM2	P57087	298 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ZXDA	P98168	799 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	FANCC	Q00597	558 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PTK2	Q05397	1052 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SCML4	Q8N228	414 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	NEK11	Q8NG66	645 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	UBA3	Q8TBC4	463 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		10	□□□□□ -0.81

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