RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 NFATC1O95644 943 aa23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 PXNP49023 591 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 SPEM2Q0P670 501 aa23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 PKN3Q6P5Z2 889 aa23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 ACOT1Q86TX2 421 aa23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 TMC2Q8TDI7 906 aa23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 FBXO32Q969P5 355 aa23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 KCNK16Q96T55 309 aa23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 RNF38Q9H0F5 515 aa23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 VNN1O95497 513 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 PRR29P0C7W0 189 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 SDHBP21912 280 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 PIK3CAP42336 1068 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 LMNB2Q03252 620 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 FBXO43Q4G163 708 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 CPQQ9Y646 472 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 PTPRDP23468 1912 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 IKBKBO14920 756 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 RETP07949 1114 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 KRT13P13646 458 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 HOXA6P31267 233 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 HOXC13P31276 330 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 VAMP7P51809 220 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 ZACNQ401N2 412 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 SV2AQ7L0J3 742 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 WDR5BQ86VZ2 330 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 TAF4BQ92750 862 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM30AQ9NV96 361 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 AP1G2O75843 785 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 RHOBTB3O94955 611 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC192P0DO97 292 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 TCF3P15923 654 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 NR2F2P24468 414 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 SLC7A9P82251 487 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 ARHGAP8P85298 464 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 ORC1Q13415 861 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 FAM35AQ86V20 835 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 SDCBP2Q9H190 292 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 CFAP97Q9P2B7 532 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 A0A1W2PQ27 194 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 A0A1W2PQ64 194 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 A0A1W2PQD8 194 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF202O95125 648 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 HLA-DRAP01903 254 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 NDST1P52848 882 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 ZXDBP98169 803 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 DPYDQ12882 1025 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 NACA2Q9H009 215 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 KRT82Q9NSB4 513 aa23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.34■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 ADAM9Q13443 819 aa23.34■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 HECTD3Q5T447 861 aa23.34■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.34■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 CAMKK1Q8N5S9 505 aa23.34■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.34■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 OVCA2Q8WZ82 227 aa23.34■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 PARD6AQ9NPB6 346 aa23.34■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 DLL3Q9NYJ7 618 aa23.34■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.33■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 MAPK13O15264 365 aa23.33■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 RPP40O75818 363 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 ASS1P00966 412 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 OAS1P00973 400 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC130P13994 396 aa23.33■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 GCLMP48507 274 aa23.33■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 SLC5A3P53794 718 aa23.33■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.33■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 UNC93AQ86WB7 457 aa23.33■■□□□ 1.33
RBMS1-211ENST00000477486 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms