RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442720.5

SGO1-209, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 2,266 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-209ENST00000442720 SPATA18Q8TC71 538 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 BANF1O75531 89 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 PHBP35232 272 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 GPX6P59796 221 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 GAD2Q05329 585 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 DPYSL3Q14195 570 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 GRB14Q14449 540 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 RASA2Q15283 850 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 TINF2Q9BSI4 451 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 GRAP2O75791 330 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 KRT15P19012 456 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 CDC42EP1Q00587 391 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 IL9RQ01113 521 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 CDO1Q16878 200 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 CCDC14Q49A88 953 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 RAB6CQ53S08 254 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 NPNTQ6UXI9 565 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 ACOT1Q86TX2 421 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 TRABDQ9H4I3 376 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SENP1Q9P0U3 644 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 GINS2Q9Y248 185 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 DPYSL4O14531 572 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SETSIPP0DME0 302 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 ROR1Q01973 937 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 NOMO1Q15155 1222 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 PKDCCQ504Y2 493 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 PMF1Q6P1K2 205 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 BEST2Q8NFU1 509 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SNX27Q96L92 541 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 TRIP11Q15643 1979 aa20.24■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 CLUHO75153 1309 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 GLTPD2A6NH11 291 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 E7ESA3 106 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 PPEF2O14830 753 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SPAG7O75391 227 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SUN1O94901 812 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 KRT81Q14533 505 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 PDK2Q15119 407 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 ZBTB6Q15916 424 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 MSS51Q4VC12 460 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 BOLA3Q53S33 107 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 EFHC2Q5JST6 749 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 TTC30AQ86WT1 665 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 RNF157Q96PX1 679 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SMC6Q96SB8 1091 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 GPR32O75388 356 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SLC18A1P54219 525 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SNX16P57768 344 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SLC6A3Q01959 620 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SCYL2Q6P3W7 929 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 TMEM110Q86TL2 294 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 HESX1Q9UBX0 185 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 FETUBQ9UGM5 382 aa20.23■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 GSTA1P08263 222 aa20.22■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 SSTR1P30872 391 aa20.22■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 ATP11AP98196 1134 aa20.22■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa20.22■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SGO1-209ENST00000442720 PALM2Q8IXS6 379 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms