RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 ARSAP15289 507 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 NBL1P41271 181 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 RPS9P46781 194 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 SLC5A3P53794 718 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 STX17P56962 302 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 FZD5Q13467 585 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 RUNX3Q13761 415 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 MORC3Q14149 939 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 PON2Q15165 354 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 TXNDC11Q6PKC3 985 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 SMOQ99835 787 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 FAM83CQ9BQN1 747 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 HPS4Q9NQG7 708 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 R4GN57 208 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CILPO75339 1184 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 BEST1O76090 585 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 FAM200BP0CF97 657 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 SP9P0CG40 484 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 PPP3CCP48454 512 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF77Q15935 545 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 TATDN2Q93075 761 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CYFIP2Q96F07 1278 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 DNAI2Q9GZS0 605 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 SMPD4Q9NXE4 827 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 WNT6Q9Y6F9 365 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 MYH10P35580 1976 aa29.39■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 GFRA3O60609 400 aa29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 IFNAR2P48551 515 aa29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 MTAPQ13126 283 aa29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 C1orf228Q6PIY5 440 aa29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF687Q8N1G0 1237 aa29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 PATJQ8NI35 1801 aa29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 F5P12259 2224 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 MYO15AQ9UKN7 3530 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 BICDL2A1A5D9 508 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 USP4Q13107 963 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 PDGFRLQ15198 375 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZMIZ2Q8NF64 920 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 WHAMMQ8TF30 809 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 CEP63Q96MT8 703 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 ARID3AQ99856 593 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 RNF38Q9H0F5 515 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 CHRNB1P11230 501 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 LRMPQ12912 555 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC32Q14392 662 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 TTI2Q6NXR4 508 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 TSSK4Q6SA08 328 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 PDZD8Q8NEN9 1154 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 OSCP1Q8WVF1 389 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 SLC35C1Q96A29 364 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 CHRDQ9H2X0 955 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 CISHQ9NSE2 258 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 GMIPQ9P107 970 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 CPQQ9Y646 472 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 LEFTY2O00292 366 aa29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 TNFRSF10BO14763 440 aa29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 PAK1Q13153 545 aa29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 CPA6Q8N4T0 437 aa29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 PIEZO1Q92508 2521 aa29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 HELZP42694 1942 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 PFKLP17858 780 aa29.34■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZXDBP98169 803 aa29.34■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 CLEC20AQ6ZU45 233 aa29.34■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 OVCA2Q8WZ82 227 aa29.34■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa29.34■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 VPS13AQ96RL7 3174 aa29.34■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 USP34Q70CQ2 3546 aa29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 PROB1E7EW31 1015 aa29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 OAS1P00973 400 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 ASCL5Q7RTU5 278 aa29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 ATP2A3Q93084 1043 aa29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 NACA2Q9H009 215 aa29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 LINC00597Q9H2U6 94 aa29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 ECT2Q9H8V3 914 aa29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 KIAA1468Q9P260 1216 aa29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 FBXO4Q9UKT5 387 aa29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-210ENST00000440825 FMO5P49326 533 aa29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms