RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 NDUFAB1O14561 156 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAGEB2O15479 319 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 HRO43593 1189 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PROSCO94903 275 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM153BP0C7A2 387 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITGA4P13612 1032 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATF2P15336 505 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ECHS1P30084 290 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 THPOP40225 353 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PMS2P54278 862 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNX16P57768 344 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 COPS2P61201 443 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOMO3P69849 1222 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 POU5F1BQ06416 359 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 MCL1Q07820 350 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 DGKDQ16760 1214 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM153CQ494X1 144 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTMPQ5BVD1 217 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 EMC10Q5UCC4 262 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 DUPD1Q68J44 220 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 MON1BQ7L1V2 547 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 SERINC5Q86VE9 423 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF149Q8NC42 400 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 EXD1Q8NHP7 514 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 SUSD6Q92537 303 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TATDN2Q93075 761 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC114Q96M63 670 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF292O60281 2723 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACKR2O00590 384 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 FSCN2O14926 492 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 SORBS3O60504 671 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TJP3O95049 919 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 F2P00734 622 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITGB1P05556 798 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF286BP0CG31 522 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITIH2P19823 946 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 RRM1P23921 792 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATICP31939 592 aa6.64□□□□□ -1.35
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SHQ1P1-201ENST00000437111 NRIP1P48552 1158 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PEX5P50542 639 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLTPP55058 493 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP2R2AP63151 447 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 SP2Q02086 613 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT17Q04695 432 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF844Q08AG5 666 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 LAMC2Q13753 1193 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTK6Q13882 451 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC38Q5VT99 294 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZBTB33Q86T24 672 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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