RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 IZUMO3Q5VZ72 239 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 MFSD5Q6N075 450 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD52Q8NB46 1076 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 TEKT4Q8WW24 435 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 TBCBQ99426 244 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 PHACTR1Q9C0D0 580 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 ZWILCHQ9H900 591 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF148Q9UQR1 794 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 NME7Q9Y5B8 376 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 A8MXQ7 604 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF487B1APH4 448 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 WARSP23381 471 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 MDH1P40925 334 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 ACADSBP45954 432 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP2R2AP63151 447 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 C12orf29Q8N999 325 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 APPL2Q8NEU8 664 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 RXFP2Q8WXD0 754 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 DEFB118Q96PH6 123 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 APOL6Q9BWW8 343 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC38A7Q9NVC3 462 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 AGTP01019 485 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 PDGFRAP16234 1089 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 TNIP3Q96KP6 325 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 SNX25Q9H3E2 840 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 CENPHQ9H3R5 247 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 SEPT4O43236 478 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 TCEA3O75764 348 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 SHBGP04278 402 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 MORF4L2Q15014 288 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 PDK2Q15119 407 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 BOLA3Q53S33 107 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 GNASQ5JWF2 1037 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 PMF1Q6P1K2 205 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 PCGF5Q86SE9 256 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 KCTD6Q8NC69 237 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 HSFY1Q96LI6 401 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 MYADML2A6NDP7 307 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 SMAPO00193 183 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 TTC4O95801 387 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 APOC2P02655 101 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 ARSEP51690 589 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 TFDP2Q14188 446 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP19.52■□□□□ 0.721e-6■■■■□ 23.8
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF39Q9H2S5 420 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 CDY2AQ9Y6F7 541 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 HUS1O60921 280 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 ABHD2P08910 425 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 RDXP35241 583 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPN9P43378 593 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM47CQ5HY64 1035 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 SERINC5Q86VE9 423 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 MAP7D3Q8IWC1 876 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 SHOC2Q9UQ13 582 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 PRPSAP2O60256 369 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 CST8O60676 142 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 CHKAP35790 457 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP1A2P50993 1020 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 PDE4CQ08493 712 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 P3H1Q32P28 736 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC26A9Q7LBE3 791 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC25Q86WR0 208 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 SERPINB12Q96P63 405 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 KLK14Q9P0G3 267 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 SPTLC1O15269 473 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 CAND2O75155 1236 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 RARBP10826 455 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 SDC4P31431 198 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 GJA8P48165 433 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 RGS19P49795 217 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 SMTNL2Q2TAL5 461 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 NBPF20Q3BBV1 942 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC14Q49A88 953 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 TRNP1Q6NT89 227 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 ADGRF2Q8IZF7 708 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 ACTL9Q8TC94 416 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM49BQ9NUQ9 324 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms