RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 RBP3P10745 1247 aa28.91■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 CDH6P55285 790 aa28.91■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 TFDP2Q14188 446 aa28.91■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 NOMO1Q15155 1222 aa28.91■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa28.91■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD22Q5VYY1 191 aa28.91■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 SNTG2Q9NY99 539 aa28.91■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 SNX9Q9Y5X1 595 aa28.91■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 GPR32O75388 356 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 STX2P32856 288 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 SLC18A1P54219 525 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 OLFML1Q6UWY5 402 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 CATSPER4Q7RTX7 472 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 MAGEB18Q96M61 343 aa28.9■■■□□ 2.22
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CERS1-201ENST00000429504 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA8MH3BSY2 632 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 STIP1P31948 543 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
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CERS1-201ENST00000429504 DPYSL3Q14195 570 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 FAM110CQ1W6H9 321 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
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CERS1-201ENST00000429504 PLEKHH3Q7Z736 793 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 FAM71DQ8N9W8 422 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 ATP11CQ8NB49 1132 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 USP6NLQ92738 828 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 MLXIPLQ9NP71 852 aa28.9■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa28.89■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 PIK3R2O00459 728 aa28.89■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.226e-6■■□□□ 11.6
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CERS1-201ENST00000429504 PHBP35232 272 aa28.89■■■□□ 2.22
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CERS1-201ENST00000429504 FBXW10Q5XX13 1052 aa28.89■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 PMF1Q6P1K2 205 aa28.89■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 TMEM110Q86TL2 294 aa28.89■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 TTC30AQ86WT1 665 aa28.89■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 BEST2Q8NFU1 509 aa28.89■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 GDAP1Q8TB36 358 aa28.89■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 CXCL16Q9H2A7 254 aa28.89■■■□□ 2.22
CERS1-201ENST00000429504 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
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CERS1-201ENST00000429504 SCTRP47872 440 aa28.89■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 GPX6P59796 221 aa28.89■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 ROR1Q01973 937 aa28.89■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 MAP7D3Q8IWC1 876 aa28.89■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 NRCAMQ92823 1304 aa28.88■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 PPEF2O14830 753 aa28.88■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 RGS7P49802 495 aa28.88■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 SNX16P57768 344 aa28.88■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 BOLA3Q53S33 107 aa28.88■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 SESTD1Q86VW0 696 aa28.88■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 VSIG1Q86XK7 387 aa28.88■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 STK32AQ8WU08 396 aa28.88■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 SLC35F5Q8WV83 523 aa28.88■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 CNTN3Q9P232 1028 aa28.88■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa28.88■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 GINS2Q9Y248 185 aa28.88■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 SLC6A3Q01959 620 aa28.87■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 PDE4CQ08493 712 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 TMEM62Q0P6H9 643 aa28.87■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 ANKMY2Q8IV38 441 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 RNF157Q96PX1 679 aa28.87■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 HESX1Q9UBX0 185 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 A6NJR5 290 aa28.87■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 GRAP2O75791 330 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 TMEM63AO94886 807 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 F2P00734 622 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 IL9RQ01113 521 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 CDO1Q16878 200 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 MSS51Q4VC12 460 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 RAB6CQ53S08 254 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 CAPN12Q6ZSI9 719 aa28.87■■■□□ 2.21
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