RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428316.1

RPSAP46-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP46, Length 882 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP46-201ENST00000428316 LINC00597Q9H2U6 94 aa12.88□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 LMAN1LQ9HAT1 526 aa12.88□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 TRPC7Q9HCX4 862 aa12.88□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa12.88□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.88□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa12.88□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 OBSL1O75147 1896 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 NCAM2O15394 837 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 STX10O60499 249 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 AP1G2O75843 785 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 ARSAP15289 507 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 YWHAQP27348 245 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 PPP1R2P41236 205 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 MAGEA9P43362 315 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC5A3P53794 718 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 RAD23BP54727 409 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 USP4Q13107 963 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 MTAPQ13126 283 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 CAMK4Q16566 473 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 CLEC20AQ6ZU45 233 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 UBR7Q8N806 425 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC4A11Q8NBS3 891 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 LMO3Q8TAP4 145 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 NELFBQ8WX92 580 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 OVCA2Q8WZ82 227 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 NELL1Q92832 810 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 MSANTD3Q96H12 275 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 MED10Q9BTT4 135 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 NT5C1AQ9BXI3 368 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 EBF3Q9H4W6 596 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 CISHQ9NSE2 258 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM49BQ9NUQ9 324 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 COMMD8Q9NX08 183 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 EHD2Q9NZN4 543 aa12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 CACNA1HO95180 2353 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 TDGF1P13385 188 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 CD58P19256 250 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 MARSP56192 900 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 MAP3K7CLP57077 242 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 STIM1Q13586 685 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 CCINQ13939 588 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 MTF1Q14872 753 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 EML3Q32P44 896 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 KLHL10Q6JEL2 608 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 SH3RF2Q8TEC5 729 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 OSCP1Q8WVF1 389 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 IMPG2Q9BZV3 1241 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 CHRDQ9H2X0 955 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 KRT82Q9NSB4 513 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa12.86□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 F5P12259 2224 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 LEFTY2O00292 366 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 COCHO43405 550 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 ADORA2BP29275 332 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 FMO5P49326 533 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 STX17P56962 302 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 PON2Q15165 354 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 PDGFRLQ15198 375 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 GAB4Q2WGN9 574 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF528Q3MIS6 628 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF394Q53GI3 561 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 TCERG1LQ5VWI1 586 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 C1orf228Q6PIY5 440 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 ASCL5Q7RTU5 278 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 TRIM59Q8IWR1 403 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 KIAA1958Q8N8K9 716 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 TRIML1Q8N9V2 468 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM176AQ96HP8 235 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 SLITRK1Q96PX8 696 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 ECT2Q9H8V3 914 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 C2orf42Q9NWW7 574 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 OSER1Q9NX31 292 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 GMIPQ9P107 970 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 FBXO4Q9UKT5 387 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 CTNND2Q9UQB3 1225 aa12.85□□□□□ -0.35
RPSAP46-201ENST00000428316 USP3Q9Y6I4 520 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms