RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC8A3P57103 927 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SNX16P57768 344 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAP1Q03518 808 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TIGD5Q53EQ6 642 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIAA0319Q5VV43 1072 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR6B2Q6IFH4 312 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRNP1Q6NT89 227 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EMC1Q8N766 993 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRELID2Q8N945 189 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC35F5Q8WV83 523 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HERVK_113Q902F9 699 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 VWCEQ96DN2 955 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MIS12Q9H081 205 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARFGAP3Q9NP61 516 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ST7Q9NRC1 585 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STIM2Q9P246 746 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WDR35Q9P2L0 1181 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HCSTQ9UBK5 93 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HESX1Q9UBX0 185 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ESYT3A0FGR9 886 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 I3L4J1 428 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLDN5O00501 218 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GABRDO14764 452 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NRP1O14786 923 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FSCN2O14926 492 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SART1O43290 800 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PSTPIP1O43586 416 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 B4GALT3O60512 393 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERLIN1O75477 346 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SASH3O75995 380 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TUBBP07437 444 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SETSIPP0DME0 302 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RARAP10276 462 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYN1P17600 705 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PSMA2P25787 234 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPM1AP35813 382 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDR1P51861 262 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BCAR1P56945 870 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DEFB103AP81534 67 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TSPY1Q01534 308 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GUCY2DQ02846 1103 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRADDQ15628 312 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM240Q5SV17 173 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RHOT1Q8IXI2 618 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KATNAL2Q8IYT4 538 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNS4Q8IZW8 715 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NIPA2Q8N8Q9 360 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC2A14Q8TDB8 520 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RUBCNQ92622 972 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF558Q96NG5 402 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EPB41L5Q9HCM4 733 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GDF3Q9NR23 364 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KLHL11Q9NVR0 708 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AMACRQ9UHK6 382 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDH9Q9ULB4 789 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 INSL6Q9Y581 213 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 F8W810 466 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PI4K2BG5E9Z4 385 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H7C4K7 107 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TTI1O43156 1089 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PHF2O75151 1096 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GJB5O95377 273 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GALTP07902 379 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MCM3P25205 808 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BRCC3P46736 316 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC11A1P49279 550 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CARSP49589 748 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GATMP50440 423 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BST2Q10589 180 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAF5Q15542 800 aa10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms