RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 CAVIN2O95810 425 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 VIPR2P41587 438 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 RAPGEF1Q13905 1077 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 UBA3Q8TBC4 463 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ZFP14Q9HCL3 533 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 TRPC7Q9HCX4 862 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 HESX1Q9UBX0 185 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ALADP13716 330 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 UCHL3P15374 230 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 SYCP1Q15431 976 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 LCLAT1Q6UWP7 414 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 FBXO32Q969P5 355 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 SLITRK1Q96PX8 696 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 PNPLA8Q9NP80 782 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 IL37Q9NZH6 218 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 C2orf78A6NCI8 922 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 TULP2O00295 520 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 NARSO43776 548 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ABL1P00519 1130 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 BCAT1P54687 386 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ZXDAP98168 799 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 PDE4CQ08493 712 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 CNGA2Q16280 664 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 MON1AQ86VX9 555 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ELSPBP1Q96BH3 223 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 NCANO14594 1321 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF840PA6NDX5 716 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ECI2O75521 394 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.623e-9■□□□□ 10.4
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC8A3P57103 927 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 PIGZQ86VD9 579 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 GANQ9H2C0 597 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 FBXO44Q9H4M3 255 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 TRPV4Q9HBA0 871 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 COMMD8Q9NX08 183 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 M0QYV0 167 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 EPHB6O15197 1021 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 CYP26A1O43174 497 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 PRAMEF12O95522 483 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 GNA15P30679 374 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 BST2Q10589 180 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 PKDCCQ504Y2 493 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 EDAQ92838 391 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 RSPRY1Q96DX4 576 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC22A12Q96S37 553 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 CYP2S1Q96SQ9 504 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 TSPY26PQ9H489 355 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 GMIPQ9P107 970 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM92AA1XBS5 289 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 TEX33O43247 280 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 AVPR1AP37288 418 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP3CCP48454 512 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 KIF11P52732 1056 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 TPM4P67936 248 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 STILQ15468 1287 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 VITQ6UXI7 678 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ZMYM5Q9UJ78 669 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 DUSP12Q9UNI6 340 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 HEPACAM2A8MVW5 462 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 THAP12O43422 761 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 RFX1P22670 979 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 PGFP49763 221 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 GRM2Q14416 872 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 UBALD2Q8IYN6 164 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 PDZD8Q8NEN9 1154 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF606Q8WXB4 792 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 OVCA2Q8WZ82 227 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 SOBPA7XYQ1 873 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 SETSIPP0DME0 302 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 WEE1P30291 646 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2E3-202ENST00000410062 CLCN1P35523 988 aa25.14■■□□□ 1.62
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