RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 YWHAQP27348 245 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 FANCCQ00597 558 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 CNGA2Q16280 664 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 PKDCCQ504Y2 493 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 GPR158Q5T848 1215 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 NEK11Q8NG66 645 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 IL37Q9NZH6 218 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 FAM92AA1XBS5 289 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 ANHXE9PGG2 379 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 F8VZ95 297 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 M0QYV0 167 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 CYP26A1O43174 497 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 ASGR2P07307 311 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 SETSIPP0DME0 302 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 SLC8A3P57103 927 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 PDE4CQ08493 712 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 TAF10Q12962 218 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 MTSS1LQ765P7 747 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 RNF214Q8ND24 703 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 FGF14Q92915 247 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 FBXO32Q969P5 355 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 ASB16Q96NS5 453 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 STK33Q9BYT3 514 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 TASP1Q9H6P5 420 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 KCNK12Q9HB15 430 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 COMMD8Q9NX08 183 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 TULP2O00295 520 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 THAP12O43422 761 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 FCARP24071 287 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 CLCN1P35523 988 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 JAM2P57087 298 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 MEA1Q16626 185 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 PTPN21Q16825 1174 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 PARM1Q6UWI2 310 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 PIGZQ86VD9 579 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 UBA3Q8TBC4 463 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 SMARCD2Q92925 531 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 NCANO14594 1321 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 A0A1W2PQC6 194 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 MED7O43513 233 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 PLA2G4AP47712 749 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 KIF11P52732 1056 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 TXNDC8Q6A555 127 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 COL4A2P08572 1712 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 SOBPA7XYQ1 873 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 PRAMEF12O95522 483 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 PPP3CCP48454 512 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 PTK2Q05397 1052 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 NR1I3Q14994 352 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 RAB41Q5JT25 222 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 MON1AQ86VX9 555 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 NXPE3Q969Y0 559 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 KXD1Q9BQD3 176 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 GMIPQ9P107 970 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 SCML2Q9UQR0 700 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD12-202ENST00000406506 C2orf78A6NCI8 922 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 TNFRSF10AO00220 468 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 CFHP08603 1231 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 WEE1P30291 646 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 UBASH3AP57075 661 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 SPAG5Q96R06 1193 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 IFNKQ9P0W0 207 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 286.9 ms