RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 SERPINC1P01008 464 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 BRD2P25440 801 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 AVPR1AP37288 418 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 PDE6CP51160 858 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 MON1AQ86VX9 555 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 RSAD2Q8WXG1 361 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 ERGIC2Q96RQ1 377 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 ECI2O75521 394 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 SETSIPP0DME0 302 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 GNA15P30679 374 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 PTK2Q05397 1052 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 TXNDC8Q6A555 127 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 TTC30AQ86WT1 665 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 UBALD2Q8IYN6 164 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 CMTM8Q8IZV2 173 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 SLC44A3Q8N4M1 653 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 MAB21L3Q8N8X9 362 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 NEK11Q8NG66 645 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 ELSPBP1Q96BH3 223 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 SLC46A2Q9BY10 475 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 STK33Q9BYT3 514 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 SIK3Q9Y2K2 1263 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 FHOD1Q9Y613 1164 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 PTPRDP23468 1912 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 BDP1A6H8Y1 2624 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 HHLA1C9JL84 531 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 TADA3O75528 432 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 WEE1P30291 646 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 BPIFB4P59827 614 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 POTEHQ6S545 545 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 TRPC7Q9HCX4 862 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 NCANO14594 1321 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 FAM92AA1XBS5 289 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF840PA6NDX5 716 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 PI4K2BG5E9Z4 385 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 DPYSL4O14531 572 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 ABL1P00519 1130 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 PFKLP17858 780 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 PDE4CQ08493 712 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 PIGZQ86VD9 579 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 FAM71AQ8IYT1 594 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 UBA3Q8TBC4 463 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 KXD1Q9BQD3 176 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 DOCK8Q8NF50 2099 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 M0QYV0 167 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 THAP12O43422 761 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 KIF11P52732 1056 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 TANGO2Q6ICL3 276 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF606Q8WXB4 792 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 SCML2Q9UQR0 700 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 CYP26A1O43174 497 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 KLK7P49862 253 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 MEA1Q16626 185 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 PKDCCQ504Y2 493 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 ZSWIM1Q9BR11 485 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 GANQ9H2C0 597 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC4Q9HBW1 653 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 CUL9Q8IWT3 2517 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 A0A1B0GTH6 734 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 CKMP06732 381 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 USP17L7P0C7H9 530 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 PLA2G4AP47712 749 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 ZXDAP98168 799 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 EDAQ92838 391 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 SPAG5Q96R06 1193 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 OBP2AQ9NY56 170 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 F8VZ95 297 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 CALCAP01258 141 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 HDCP19113 662 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 FCARP24071 287 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 VIPR2P41587 438 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF445P59923 1031 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 KCTD13Q8WZ19 329 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 TDP1Q9NUW8 608 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 GMIPQ9P107 970 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 DUSP12Q9UNI6 340 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 USP3Q9Y6I4 520 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 TEX33O43247 280 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 SRFP11831 508 aa28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms