RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa28.82■■■□□ 2.2
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GNPTAB-202ENST00000392919 PATJQ8NI35 1801 aa28.81■■■□□ 2.2
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GNPTAB-202ENST00000392919 PRAMEF12O95522 483 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 SP9P0CG40 484 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 PON1P27169 355 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 RAD23BP54727 409 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM65Q6PJ69 517 aa28.81■■■□□ 2.2
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GNPTAB-202ENST00000392919 CLDN23Q96B33 292 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 KREMEN1Q96MU8 473 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC46A2Q9BY10 475 aa28.81■■■□□ 2.2
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GNPTAB-202ENST00000392919 TASP1Q9H6P5 420 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TRPV5Q9NQA5 729 aa28.81■■■□□ 2.2
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GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF687Q8N1G0 1237 aa28.8■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC4A11Q8NBS3 891 aa28.8■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ZFYVE19Q96K21 471 aa28.8■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 NELL2Q99435 816 aa28.8■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 CBX8Q9HC52 389 aa28.8■■■□□ 2.2
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GNPTAB-202ENST00000392919 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa28.79■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 GJB7Q6PEY0 223 aa28.79■■■□□ 2.2
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GNPTAB-202ENST00000392919 YAF2Q8IY57 180 aa28.79■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM176AQ96HP8 235 aa28.79■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 SIX2Q9NPC8 291 aa28.79■■■□□ 2.2
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GNPTAB-202ENST00000392919 SLC2A14Q8TDB8 520 aa28.78■■■□□ 2.2
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GNPTAB-202ENST00000392919 SOX9P48436 509 aa28.77■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TTC8Q8TAM2 541 aa28.77■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM3CQ92520 227 aa28.77■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 CYFIP2Q96F07 1278 aa28.77■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 C8orf48Q96LL4 319 aa28.77■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
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GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa28.76■■■□□ 2.19
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GNPTAB-202ENST00000392919 BECN2A8MW95 431 aa28.75■■■□□ 2.19
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
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GNPTAB-202ENST00000392919 LAMTOR5O43504 91 aa28.75■■■□□ 2.19
GNPTAB-202ENST00000392919 CAVIN2O95810 425 aa28.75■■■□□ 2.19
GNPTAB-202ENST00000392919 TPM2P07951 284 aa28.75■■■□□ 2.19
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GNPTAB-202ENST00000392919 CSH2P0DML3 217 aa28.75■■■□□ 2.19
GNPTAB-202ENST00000392919 WEE1P30291 646 aa28.75■■■□□ 2.19
GNPTAB-202ENST00000392919 RPS9P46781 194 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
GNPTAB-202ENST00000392919 TXNDC8Q6A555 127 aa28.75■■■□□ 2.19
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM270Q6UE05 265 aa28.75■■■□□ 2.19
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