RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 TAF10Q12962 218 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 ORC1Q13415 861 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 PDGFRLQ15198 375 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 ACOT1Q86TX2 421 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 FAM35AQ86V20 835 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 SPEM1Q8N4L4 309 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 SH3RF2Q8TEC5 729 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 TNIP3Q96KP6 325 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 KCNK16Q96T55 309 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 MED10Q9BTT4 135 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 LILRB5O75023 590 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 NDST1P52848 882 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 ZXDBP98169 803 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 OSCP1Q8WVF1 389 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 FAXDC2Q96IV6 333 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 HMGXB4Q9UGU5 601 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 WNT6Q9Y6F9 365 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 ATP8B3O60423 1300 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 TCF3P15923 654 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 ASPAP45381 313 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 PPP3CCP48454 512 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 FUKQ8N0W3 1084 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 NUP93Q8N1F7 819 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 EEF2KMTQ96G04 330 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 RNF38Q9H0F5 515 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 C2orf42Q9NWW7 574 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-201ENST00000378543 ABL1P00519 1130 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC130P13994 396 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 PFKLP17858 780 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 YWHAQP27348 245 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 IFNAR2P48551 515 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 PDE6CP51160 858 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 PPP2R5DQ14738 602 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM196Q5HYL7 178 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 FSTL4Q6MZW2 842 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 CRYBG2Q8N1P7 616 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 TRIML1Q8N9V2 468 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC150Q8NCX0 1101 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 ECT2Q9H8V3 914 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM8AQ9HCN3 771 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 GPR179Q6PRD1 2367 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 GJA4P35212 333 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 EML3Q32P44 896 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 KRT39Q6A163 491 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD40Q6AI12 368 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 UNC93AQ86WB7 457 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 SYNPOQ8N3V7 929 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 CPA6Q8N4T0 437 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 SCAMP5Q8TAC9 235 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 SMARCD1Q96GM5 515 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 CEP63Q96MT8 703 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 LINC00597Q9H2U6 94 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 BICDL2A1A5D9 508 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 LEFTY2O00292 366 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 TNFRSF10BO14763 440 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 AP1G2O75843 785 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 OLFM2O95897 454 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 OAS1P00973 400 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 NRLP54845 237 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 SLC7A9P82251 487 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 MORC3Q14149 939 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 DCLK2Q8N568 766 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 C12orf29Q8N999 325 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 ZMIZ2Q8NF64 920 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 RUBCNQ92622 972 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 FBXO32Q969P5 355 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 TWNKQ96RR1 684 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 DNAI2Q9GZS0 605 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 EPC1Q9H2F5 836 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 KRT82Q9NSB4 513 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 CPQQ9Y646 472 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 K7ESF4 209 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 BEST1O76090 585 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 HOXC13P31276 330 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 GALK1P51570 392 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 SLC5A3P53794 718 aa24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms