RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375135.3

FGD1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGD1, Length 4,275 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1-201ENST00000375135 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa15.99■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.99■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 Q9H521 79 aa15.99■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 BCAP29Q9UHQ4 241 aa15.99■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PSTPIP1O43586 416 aa15.99■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 BANF1O75531 89 aa15.99■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 TSPY1Q01534 308 aa15.99■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 FITM2Q8N6M3 262 aa15.99■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.99■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 GPRC5DQ9NZD1 345 aa15.99■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 SH3BP5O60239 455 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 NCAM1P13591 858 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 HSD17B4P51659 736 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 EXD1Q8NHP7 514 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 DCLRE1BQ9H816 532 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 GOLGA8CPA6NN73 597 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 TBC1D12O60347 775 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 B3GAT3O94766 335 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 BGNP21810 368 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 TRIP10Q15642 601 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 IL31Q6EBC2 164 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 JADE1Q6IE81 842 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 BRSK2Q8IWQ3 736 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 RMDN2Q96LZ7 410 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 LRGUKQ96M69 825 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 M0QYT0 321 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PMLP29590 882 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 CCNG2Q16589 344 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 BTBD8Q5XKL5 378 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 NOTUMQ6P988 496 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PPIL6Q8IXY8 311 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 TCP10LQ8TDR4 215 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 WWP1Q9H0M0 922 aa15.98■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 TGFB3P10600 412 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 CETPP11597 493 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 ADORA2AP29274 412 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 MARSP56192 900 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 CUL3Q13618 768 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 DAW1Q8N136 415 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 NETO2Q8NC67 525 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PAFAH2Q99487 392 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 SERPINB3P29508 390 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 GRIK1P39086 918 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 BTKQ06187 659 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 HIC1Q14526 733 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 CHI3L2Q15782 390 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 RASGEF1CQ8N431 466 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 CLEC4DQ8WXI8 215 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 CALB2P22676 271 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 SPIRE1Q08AE8 756 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 NFIL3Q16649 462 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 LRRC6Q86X45 466 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 TTC39CQ8N584 583 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 TTC8Q8TAM2 541 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 ADAM32Q8TC27 787 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 BTNL10A8MVZ5 291 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PDHXO00330 501 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 ACKR2O00590 384 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 LGR5O75473 907 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 UNC5CO95185 931 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 MX2P20592 715 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 ART3Q13508 389 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PCSK7Q16549 785 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 SPRED3Q2MJR0 410 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 ZACNQ401N2 412 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.97■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 UMODL1Q5DID0 1318 aa15.96■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 CST3P01034 146 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 BMPR2Q13873 1038 aa15.96■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.96■□□□□ 0.15
FGD1-201ENST00000375135 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms