RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF556Q9HAH1 456 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 DCDC2Q9UHG0 476 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CLCA2Q9UQC9 943 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087WZ62 844 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 MAN1A2O60476 641 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 PPP3CCP48454 512 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINB10P48595 397 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 LHX1P48742 406 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 PSMC6P62333 389 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SKOR1P84550 965 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SLC47A2Q86VL8 602 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 RBBP8Q99708 897 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 BATF3Q9NR55 127 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 AP4E1Q9UPM8 1137 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 FAM131BQ86XD5 332 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CAND2O75155 1236 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 COPAP53621 1224 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 PGBD3Q8N328 593 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 STX19Q8N4C7 294 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SLIT1O75093 1534 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SUPT7LO94864 414 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SLC20A1Q8WUM9 679 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3C2BO00750 1634 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 PJA2O43164 708 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 PGM5Q15124 567 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 THAP11Q96EK4 314 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 DIP2BQ9P265 1576 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 DSG3P32926 999 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 FAR2Q96K12 515 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 C2CD2LO14523 706 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 EGFRP00533 1210 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 APOA1P02647 267 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 OCM2P0CE71 109 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SGO1Q5FBB7 561 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC9Q8WXX5 260 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SELENONQ9NZV5 590 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 ACTL9Q8TC94 416 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 OTULINQ96BN8 352 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 KDM1AO60341 852 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D4O60343 1298 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINB8P50452 374 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 EMC1Q8N766 993 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 WWOXQ9NZC7 414 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 VWA5AO00534 786 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 EFCAB14O75071 495 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 LAYNQ6UX15 382 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB39O15060 712 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 VPS26AO75436 327 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CPA2P48052 419 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 MYO1GB0I1T2 1018 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CXCL8P10145 99 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms