RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 IKBKGQ9Y6K9 419 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 PDLIM1O00151 329 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 P4HA2O15460 535 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 MED24O75448 989 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 MT-ND3P03897 115 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 PROCP04070 461 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 TFAP2AP05549 437 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 KRT5P13647 590 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 HSPA6P17066 643 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 SLC5A2P31639 672 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 MYL7Q01449 175 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 MAP3K10Q02779 954 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 HPS6Q86YV9 775 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 ATP11CQ8NB49 1132 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 NCSTNQ92542 709 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 SLC35B4Q969S0 331 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 SPATA17Q96L03 361 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 SENP7Q9BQF6 1050 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 A8MU76 341 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 POLR2MP0CAP2 368 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 SRGAP2BP0DMP2 458 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 RPL5P46777 297 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 SP4Q02446 784 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 KRT81Q14533 505 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 TLR1Q15399 786 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 ARSHQ5FYA8 562 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 OGFOD2Q6N063 350 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 CCDC80Q76M96 950 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 WHRNQ9P202 907 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 GTF2H1P32780 548 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 ARSEP51690 589 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 NPEPPSP55786 919 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 EML3Q32P44 896 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 MOB2Q70IA6 237 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 GMEB1Q9Y692 573 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 GOLGA8IPA6NC78 632 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 GOLGA8JA6NMD2 632 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 CYB561D2O14569 222 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 FMO5P49326 533 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 GPR162Q16538 588 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 NRF1Q16656 503 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 PDSS2Q86YH6 399 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 MMP19Q99542 508 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 CENPOQ9BU64 300 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 CYLDQ9NQC7 956 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 HTR3EA5X5Y0 456 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 CARTPTQ16568 116 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 RINT1Q6NUQ1 792 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 SLC47A2Q86VL8 602 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 PASD1Q8IV76 773 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 TPH2Q8IWU9 490 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 DENND1AQ8TEH3 1009 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 ATG4CQ96DT6 458 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 EBF4Q9BQW3 602 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 J3QRK9 145 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 MSH4O15457 936 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 CDH15P55291 814 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 PRAMEP78395 509 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 RNF111Q6ZNA4 994 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 FBXL8Q96CD0 374 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 CCT7Q99832 543 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 PGAP2Q9UHJ9 254 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 WDR37Q9Y2I8 494 aa16■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 ADM5C9JUS6 153 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 TOM1L1O75674 476 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 DGKIO75912 1065 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 SLC5A3P53794 718 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC13-201ENST00000366661 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms