RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 C4BPBP20851 252 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 NUMBP49757 651 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 PSMD7P51665 324 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 GEMP55040 296 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 NFYCQ13952 458 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 NFIXQ14938 502 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 OR8H2Q8N162 312 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 ROGDIQ9GZN7 287 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 CYP4F12Q9HCS2 524 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 DDIT4Q9NX09 232 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 17.2
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RXRA-201ENST00000356384 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 VPS26AO75436 327 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 ZNF682O95780 498 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 SPACA6W5XKT8 324 aa16.62■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 HSMCR30P0CW71 290 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 NCF4Q15080 339 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 ARMCX4Q5H9R4 360 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 DDI1Q8WTU0 396 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 EFCAB1Q9HAE3 211 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 SLC25A13Q9UJS0 675 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 A0A1W2PQJ5 194 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 16.7
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RXRA-201ENST00000356384 TKFCQ3LXA3 575 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 NLRP9Q7RTR0 991 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 THAP2Q9H0W7 228 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 PRR12Q9ULL5 1215 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 FLT1P17948 1338 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 DCDC2Q9UHG0 476 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 NDUFB5O43674 189 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 LPAR1Q92633 364 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.61■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 IQCA1LA6NCM1 817 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 TK2O00142 265 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 PARNO95453 639 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 TAF6P49848 677 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 CCDC157Q569K6 752 aa16.6■□□□□ 0.25
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RXRA-201ENST00000356384 ST13P50502 369 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 FOXO4P98177 505 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 ORC1Q13415 861 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 BOLA3Q53S33 107 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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RXRA-201ENST00000356384 LRG1P02750 347 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 ADRA2BP18089 450 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 FLT3P36888 993 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 SERPINB8P50452 374 aa16.6■□□□□ 0.25
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RXRA-201ENST00000356384 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 KLK14Q9P0G3 267 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 MAPK1P28482 360 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 FAR2Q96K12 515 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 GINS4Q9BRT9 223 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 INTS13Q9NVM9 706 aa16.6■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 SLC11A2P49281 568 aa16.59■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 NOTUMQ6P988 496 aa16.59■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 CYP4Z1Q86W10 505 aa16.59■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 LRRC6Q86X45 466 aa16.59■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 SCUBE1Q8IWY4 988 aa16.59■□□□□ 0.25
RXRA-201ENST00000356384 DPP10Q8N608 796 aa16.59■□□□□ 0.25
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