RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 YARSP54577 528 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
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SPNS1-204ENST00000352260 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-204ENST00000352260 TSC22D3Q99576 134 aa19.53■□□□□ 0.72
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SPNS1-204ENST00000352260 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-204ENST00000352260 KLHL14Q9P2G3 628 aa19.53■□□□□ 0.72
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SPNS1-204ENST00000352260 FAM210AQ96ND0 272 aa19.5■□□□□ 0.71
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SPNS1-204ENST00000352260 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-204ENST00000352260 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-204ENST00000352260 ACTL7BQ9Y614 415 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-204ENST00000352260 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
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