RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 SLC15A5A6NIM6 579 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CBX4O00257 560 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CRTAMO95727 393 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 KLK7P49862 253 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 KYNUQ16719 465 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 C4orf33Q8N1A6 199 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 STX19Q8N4C7 294 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 SKA1Q96BD8 255 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 OTULINQ96BN8 352 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CLPBQ9H078 707 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 MSRAQ9UJ68 235 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ENDOD1O94919 500 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 PTPN7P35236 360 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 COILP38432 576 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 SGO1Q5FBB7 561 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 AGAP9Q5VTM2 703 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ERAP2Q6P179 960 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 RAD9BQ6WBX8 426 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 REREQ9P2R6 1566 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 NFASCO94856 1347 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 EVPLLA8MZ36 301 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 NCAM2O15394 837 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CARSP49589 748 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 NLRP14Q86W24 1093 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 INTS13Q9NVM9 706 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM51Q9NW97 253 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 UMODL1Q5DID0 1318 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 AKAP5P24588 427 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 LONRF1Q17RB8 773 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 HES6Q96HZ4 224 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 PPP1R36Q96LQ0 422 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 FKTNO75072 461 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 FAM107AO95990 144 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 IGFBP4P22692 258 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 GRK3P35626 688 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 LRIG3Q6UXM1 1119 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 USP38Q8NB14 1042 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 WDR41Q9HAD4 459 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 PDGFCQ9NRA1 345 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CDY1Q9Y6F8 540 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 YWHAQP27348 245 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 HIC1Q14526 733 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 AURKCQ9UQB9 309 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 DYRK3O43781 588 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 PLA2G4AP47712 749 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 RENBPP51606 427 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 NCKAP1LP55160 1127 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 SPATA21Q7Z572 469 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM199Q8N511 208 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 SMARCD1Q96GM5 515 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ADAM2Q99965 735 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 IRF6O14896 467 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 PCDH8O95206 1070 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 MCL1Q07820 350 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 ENGASEQ8NFI3 743 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 TPCN2Q8NHX9 752 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 KCNB2Q92953 911 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 FKBP9O95302 570 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 LGALS2P05162 132 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 RAP1GAPP47736 663 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 TBX4P57082 545 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 VSNL1P62760 191 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 CES5AQ6NT32 575 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 FKBP9P1Q75LS8 142 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 RXFP2Q8WXD0 754 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRO-202ENST00000348962 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms