RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 F8W810 466 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 I3L4J1 428 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CEP104O60308 925 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 B3GAT3O94766 335 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CYP11A1P05108 521 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PFKMP08237 780 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ADCY1Q08828 1119 aa6.37□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SPATA18Q8TC71 538 aa6.37□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.37□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 CCDC130P13994 396 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CD53P19397 219 aa6.37□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 PKDCCQ504Y2 493 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 METTL23Q86XA0 190 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 C3orf20Q8ND61 904 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.37□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 DSEQ9UL01 958 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SCINQ9Y6U3 715 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 COL4A6Q14031 1691 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TTC3P53804 2025 aa6.36□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.36□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 MFSD5Q6N075 450 aa6.36□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 BTBD6Q96KE9 485 aa6.36□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 RAG1P15918 1043 aa6.36□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 SH3GL1Q99961 368 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 HESX1Q9UBX0 185 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 AMFRQ9UKV5 643 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CDH9Q9ULB4 789 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.36□□□□□ -1.39
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