RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 DYNLT1P63172 113 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 TTMPQ5BVD1 217 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 DSTYKQ6XUX3 929 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 FUKQ8N0W3 1084 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 NFS1Q9Y697 457 aa18.76■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 HTRA3P83110 453 aa18.75■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 UPP1Q16831 310 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 MDH1BQ5I0G3 518 aa18.75■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PQY0 241 aa18.74■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 TP73O15350 636 aa18.74■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 TIGD5Q53EQ6 642 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 CEP85LQ5SZL2 805 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 SCYL2Q6P3W7 929 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 LRIG3Q6UXM1 1119 aa18.74■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 FAM172AQ8WUF8 416 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 ITIH2P19823 946 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 ACADSBP45954 432 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 ITGA8P53708 1063 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 MMRN1Q13201 1228 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 MBTPS1Q14703 1052 aa18.73■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 RFX6Q8HWS3 928 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 GLIS1Q8NBF1 620 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 SLAIN1Q8ND83 568 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 HSFY1Q96LI6 401 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 EPB41L4BQ9H329 900 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 CYLDQ9NQC7 956 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 EFR3BQ9Y2G0 817 aa18.73■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 GRK4P32298 578 aa18.72■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 SLC43A3Q8NBI5 491 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 SYT15Q9BQS2 421 aa18.72■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 STARD7Q9NQZ5 370 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 SQORQ9Y6N5 450 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 MYBPHLA2RUH7 354 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA6CA6NDK9 693 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA6DP0CG33 693 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 ETS1P14921 441 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 LHX1P48742 406 aa18.72■□□□□ 0.59
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