RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 EURLQ9NYK6 297 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 A0A1W2PPM1 405 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 CFAP69A5D8W1 941 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 PIK3R2O00459 728 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 TOM1L1O75674 476 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 PSMG1O95456 288 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 HOXC6P09630 235 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 NEK3P51956 506 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 SLC1A5Q15758 541 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 CNPY1Q3B7I2 92 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 GOLGA8SH3BPF8 625 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 CCNG2Q16589 344 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 PDK4Q16654 411 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 RNF181Q9P0P0 153 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 CREB3O43889 395 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 ETS2P15036 469 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 OVGP1Q12889 678 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 HHATQ5VTY9 493 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 CPB2Q96IY4 423 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 KRT82Q9NSB4 513 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 GSC2O15499 205 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 MAP3K7O43318 606 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 BANF1O75531 89 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 SCNN1BP51168 640 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 DPH6Q7L8W6 267 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 BBOF1Q8ND07 529 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 SLC1A1P43005 524 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF132P52740 706 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 BPIFB4P59827 614 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 AP1B1Q10567 949 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 MAPK6Q16659 721 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF677Q86XU0 584 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 UBR7Q8N806 425 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 STMN2Q93045 179 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 OPTNQ96CV9 577 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 PDP2Q9P2J9 529 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-201ENST00000317243 GYG2O15488 501 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC22O60826 627 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 NFICP08651 508 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 MMP8P22894 467 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ARSEP51690 589 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 GPS1Q13098 491 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 LIN9Q5TKA1 542 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 EMC1Q8N766 993 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TWNKQ96RR1 684 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 FAM192AQ9GZU8 254 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 LYNP07948 512 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 KLRC2P26717 231 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ASPAP45381 313 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 VPS52Q8N1B4 723 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 RFWD2Q8NHY2 731 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 AZIN2Q96A70 460 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SDCBP2Q9H190 292 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SBF1O95248 1867 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms