RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 RPL34P49207 117 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD6Q8NC69 237 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ADAM21Q9UKJ8 722 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 TP73O15350 636 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 OPA1O60313 960 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 FAM163BP0C2L3 166 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 VPS41P49754 854 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 DYNLT1P63172 113 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 PRUNE1Q86TP1 453 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 OR2W6PQ8NHA6 318 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ARL8AQ96BM9 186 aa23.86■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 DPYSL4O14531 572 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 FKTNO75072 461 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 BEST1O76090 585 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 IVDP26440 423 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 GRK4P32298 578 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 RPL9P32969 192 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 MBTPS1Q14703 1052 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 I3L4J1 428 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 SDC4P31431 198 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 CALCOCO2Q13137 446 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 TAZQ16635 292 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 PIGZQ86VD9 579 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 PGBD4Q96DM1 585 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP16Q9BY84 665 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 SQORQ9Y6N5 450 aa23.85■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 H0YGN5 161 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 MTMR3Q13615 1198 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 TTMPQ5BVD1 217 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 HSFY1Q96LI6 401 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 WHRNQ9P202 907 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 NFS1Q9Y697 457 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 CST8O60676 142 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 CAND2O75155 1236 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 SCYL2Q6P3W7 929 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF365Q70YC5 407 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 SLC26A9Q7LBE3 791 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM86AQ8N2M4 240 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 SNF8Q96H20 258 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 CALN1Q9BXU9 219 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 CYLDQ9NQC7 956 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 EFR3BQ9Y2G0 817 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.84■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8KD6RF30 607 aa23.83■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 PRPSAP2O60256 369 aa23.83■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 B3GAT3O94766 335 aa23.83■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 NPR3P17342 541 aa23.83■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ADCY8P40145 1251 aa23.83■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ACADSBP45954 432 aa23.83■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 LHX1P48742 406 aa23.83■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 SYT15Q9BQS2 421 aa23.83■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 MED10Q9BTT4 135 aa23.83■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ATF2P15336 505 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 ITIH2P19823 946 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 PMS2P54278 862 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 MMRN1Q13201 1228 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 GLIS1Q8NBF1 620 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 HASPINQ8TF76 798 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 ADAM33Q9BZ11 813 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 MYBPHLA2RUH7 354 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 SKIP12755 728 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 KLRC2P26717 231 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 BRCC3P46736 316 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 CDH6P55285 790 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 ADIGQ0VDE8 80 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 GRIK3Q13003 919 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.82■■□□□ 1.4
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC20AQ6ZU45 233 aa23.82■■□□□ 1.4
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