RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SFI1A8K8P3 1242 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM66O15016 1216 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G2AP14555 144 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC25AP30304 524 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 OXTRP30559 389 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFSF9P41273 254 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEA11P43364 429 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PSEN1P49768 467 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF132P52740 706 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 NCKAP1LP55160 1127 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC7A9P82251 487 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 KDSRQ06136 332 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIK2Q13002 908 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 STARD3Q14849 445 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 POSTNQ15063 836 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TEAD4Q15561 434 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ADALQ6DHV7 355 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB119Q8N690 84 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNN1Q92952 543 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA17Q96L03 361 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO16Q9Y6X6 1858 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ACACAQ13085 2346 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0B4J269 797 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 E2F8A0AVK6 867 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf78A6NCI8 922 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 K7ENM7 598 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PPEF2O14830 753 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFSF14O43557 240 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TADA3O75528 432 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GJB3O75712 270 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM13AO94988 1023 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ABL1P00519 1130 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGRP01833 764 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT18P05783 430 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
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PGGT1B-201ENST00000296642 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO1EQ12965 1108 aa8.41□□□□□ -1.06
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PGGT1B-201ENST00000296642 ECM1Q16610 540 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8.41□□□□□ -1.06
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PGGT1B-201ENST00000296642 FRMD1Q8N878 549 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TERB1Q8NA31 727 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 RIN3Q8TB24 985 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF3C6Q969F1 213 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf76Q96K31 380 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A12Q96S37 553 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 NACA2Q9H009 215 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GAREM1Q9H706 876 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CPQQ9Y646 472 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNA1EQ15878 2313 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TCHHQ07283 1943 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GFRA2O00451 464 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 WNT7AO00755 349 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 NPC1O15118 1278 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ZZEF1O43149 2961 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 DFNA5O60443 496 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAM23O75077 832 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CBFA2T3O75081 653 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TBCAO75347 108 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CTDNEP1O95476 244 aa8.4□□□□□ -1.06
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